单细胞转录组学支撑荫蔽物种存在并提醒两种具有很多种群的壳孔虫形状物种中低水平的种群遗传多样性。
大家好,欢迎观看《时空日报》第53期。本期追寻到时空/单细胞组学相关研讨文章合计5篇。以下是运用时空云渠道STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要,并辅以人工审阅,供了解参阅。
内容概要:运用高通量荧光检测的新办法挑选了大肠杆菌敲除库,发现超越20个基因对停止密码子通读至关重要,其间操控代谢的几个基因,包含cyaA和crp,能加强停止密码子通读。cyaA催化环磷酸腺苷(cyclic AMP,cAMP)的组成。RNA测序、代谢组学和生化剖析标明,删去cyaA会影响氨基酸分化和ATP的发生,然后按捺rRNA和tRNA的转录,下降通读率。单细胞剖析进一步标明,cAMP是停止密码子通读和rRNA表达异质性的首要驱动要素。
内容概要:开发了一种根据mRNA的多抗原流感疫苗,经过单细胞转录组剖析发现该疫苗在小鼠模型中表现出强壮的体液和细胞免疫应对,诱导病毒中和抗体,抗体依靠的细胞毒性效应介导的抗体和穿插反响的CD8+ T细胞免疫应对。该疫苗对H1N1、H3N2和H9N2病毒发生广泛维护效果。
内容概要:提出了一种自适应嵌入和聚类办法scAce,用于单细胞基因表达数据的聚类剖析。经过对模仿和实在数据集的核算剖析,证明了scAce在scRNA-seq数据的聚类剖析中优于现有的聚类办法,并完成了更好的聚类准确性和稳健性。
4、Mef2c在皮层神经元中正调控的基因富集于智商和教育程度相关的常见遗传变异
内容概要:经过基因表达测序,发现Mef2c基因在大脑皮层神经元中调理的基因调集中,含有与智商和教育程度相关的常见遗传变异。这些基因调集中,下调基因的功用首要与腺苷酸酰化酶信号体系有关,该体系已被证明对突触传递、学习和记忆有活跃的调理效果。此外,还发现Mef2c直接调理的三个基因CRHR1、RGS6和GABRG3与智商和/或教育程度有明显相关性。
5、单细胞转录组学支撑荫蔽物种存在并提醒两种具有很多种群的壳孔虫形状物种中低水平的种群遗传多样性
内容概要:运用单细胞转录组学办法对两种壳形虫形状物种—Hyalosphenia papilio和Hyalosphenia elegans进行研讨,发现了荫蔽物种的存在,这些物种的种群遗传多样性水平较低,标明其有用种群巨细较小,可能是由灭绝,从头久居以及有用的分散方法所造成的。该发现关于了解非形式微型真核生物的荫蔽物种具有极端重大意义。